Este juego permite ir de forma directa al entrenamiento rápido desde la pantalla de inicio, para que de esta manera el usuario pueda comenzar a ejercitarte de inmediato, sin necesidad de pasar por otros menús. Fitness Boxing 3: Your Personal Trainer también permite crear un programa de ejercicios personalizado, eligiendo entre los modos de dificultad ligero, medio e intenso, así como decidir en qué áreas se quiere que se centre el entrenamiento diario. Para ello, el jugador deberá escoger entre estiramientos normales o dinámicos, graduar la velocidad y duración de los ejercicios… Además, en el modo Ejercicio libre se podrá mezclar los elementos que mejor se adapten a cada usuario.